“這項(xiàng)技術(shù)從3個(gè)層面實(shí)現(xiàn)了‘顛覆性’,即文庫容量從有限到無限;數(shù)據(jù)挖掘從有限到無限;篩選次數(shù)從多次到一次?!辟悩I(yè)生物科技有限公司(以下簡稱賽業(yè)生物)董事長韓藍(lán)青表示,AAV衣殼蛋白的改造有利于保障目的基因遞送至人體內(nèi)的安全性和有效性,這也是解決基因治療行業(yè)技術(shù)瓶頸的重要途徑之一。
今年2月,在科技部主辦的全國顛覆性技術(shù)創(chuàng)新大賽總決賽上,由清華珠三角研究院人工智能創(chuàng)新中心與賽業(yè)生物聯(lián)合開發(fā)的“人工智能(AI)輔助基因治療遞送載體(AAV)衣殼蛋白篩選技術(shù)”脫穎而出,榮獲總決賽優(yōu)勝獎(jiǎng)。
【資料圖】
尋找顛覆性技術(shù)
AAV作為基因治療領(lǐng)域最常用的病毒載體之一,近年來已吸引一大批藥企入局,并在多種罕見病適應(yīng)癥上取得進(jìn)展?!盎贏I與生物技術(shù)的雙向聯(lián)合,我們通過深度學(xué)習(xí)建立可預(yù)測的AI模型,篩選特異性靶向的AAV衣殼突變體。”韓藍(lán)青說。
賽業(yè)生物董事長韓藍(lán)青。受訪者 供圖
韓藍(lán)青本科畢業(yè)于清華大學(xué),后獲得加拿大麥吉爾大學(xué)工程碩士和加拿大女王大學(xué)工商管理碩士,并于麻省理工學(xué)院研修,曾任職三洋電器和阿爾卡特等公司。2006年韓藍(lán)青回國創(chuàng)立了賽業(yè)生物并任董事長至今。
在韓藍(lán)青的帶領(lǐng)下,賽業(yè)生物已成為一家知名的以數(shù)據(jù)、算法和模型加速新藥研發(fā)的創(chuàng)新型CRO企業(yè)。
2017年,賽業(yè)生物與清華珠三角研究院聯(lián)合共建人工智能創(chuàng)新中心。利用AI技術(shù)對AAV衣殼蛋白的設(shè)計(jì)與篩選,正是該中心的成果之一。
韓藍(lán)青表示,該技術(shù)的研發(fā)由賽業(yè)生物基因治療CRO服務(wù)平臺提供支持,從上游的病毒載體構(gòu)建與開發(fā)、中游的疾病模型構(gòu)建,到下游的有效性評價(jià),確保同一體系下研究數(shù)據(jù)的連貫性。
“作為基因治療領(lǐng)域里應(yīng)用最廣泛的載體,AAV卻存在諸多局限性,因而大家都在嘗試尋找更好的AAV突變體?!表n藍(lán)青指出,定向進(jìn)化技術(shù)正致力于攻克此難題。
他舉例說,傳染性病毒往往有進(jìn)化分支在不斷地產(chǎn)生。自然界中,此過程發(fā)展得較為緩慢,科學(xué)家們需要借助定向突變技術(shù)“加速”病毒的進(jìn)化,以提前尋找應(yīng)對策略和治療藥物。
“用定向進(jìn)化技術(shù)尋找AAV的突變體,就類似這一過程——讓基因遞送載體在一兩年乃至幾個(gè)月內(nèi),進(jìn)化成一個(gè)人們需要的突變體?!表n藍(lán)青團(tuán)隊(duì)依托超算服務(wù)器,經(jīng)過一整夜迭代完成了基因的40次進(jìn)化。
正是在那一次,他們找到了最佳AAV序列。
“有了AI輔助,我們可以在一個(gè)超大的可能性空間里去尋找最優(yōu)解。”韓藍(lán)青說。
助力罕見病基因治療
近年來,清華珠三角研究院人工智能創(chuàng)新中心與賽業(yè)生物聯(lián)合開發(fā)了一個(gè)綜合性的生物大數(shù)據(jù)庫——罕見病數(shù)據(jù)庫。其中部署了很多AI模型,如基因突變致病性預(yù)測、突變剪接預(yù)測等,供罕見病診療研究的科研工作者免費(fèi)使用,助力我國罕見病診療事業(yè)的快速發(fā)展。
賽業(yè)生物的科研人員正在進(jìn)行技術(shù)攻關(guān)。受訪者 供圖
記者了解到,2021年,由清華珠三角研究院發(fā)起,韓藍(lán)青牽頭組建的“廣州產(chǎn)學(xué)研協(xié)同創(chuàng)新聯(lián)盟罕見病基因治療產(chǎn)學(xué)研醫(yī)技術(shù)創(chuàng)新聯(lián)盟”獲批成立。
該聯(lián)盟集中產(chǎn)學(xué)研醫(yī)優(yōu)勢,打通信息孤島壁壘,整合罕見病臨床及科研資源,利用生物信息學(xué)、AI等大數(shù)據(jù)技術(shù)手段,形成系統(tǒng)性的解決方案,賦能罕見病診療產(chǎn)業(yè),提高我國罕見病基因治療水平。
2022年,賽業(yè)生物在模式生物業(yè)務(wù)穩(wěn)步發(fā)展的基礎(chǔ)上,牢牢把握市場變革機(jī)遇,聚焦基因治療與細(xì)胞治療產(chǎn)業(yè),打造出以眼科疾病研究為特色的基因治療CRO(合同研究組織)服務(wù)平臺、以CAR-T(嵌合抗原受體T細(xì)胞免疫療法)細(xì)胞治療研究為特色的腫瘤藥效CRO服務(wù)平臺,以及神經(jīng)系統(tǒng)疾病藥效CRO服務(wù)平臺,持續(xù)賦能生命科學(xué)研究和醫(yī)藥研發(fā)。
布局罕見病及基因治療領(lǐng)域,有著韓藍(lán)青的思考。
在他看來,罕見病的治療關(guān)鍵是找到致病基因,目前的研究手段如同大海撈針,當(dāng)AI對數(shù)據(jù)進(jìn)行處理和學(xué)習(xí),可以對實(shí)驗(yàn)結(jié)果進(jìn)行預(yù)測,讓未來的科學(xué)研究和新藥研發(fā)更有針對性,極大地提高效率。
“AI與生物科技‘跨界’合作,讓我們團(tuán)隊(duì)變得越來越自信。作為清華珠三角研究院人工智能創(chuàng)新中心負(fù)責(zé)人,我希望團(tuán)隊(duì)未來能產(chǎn)生更多顛覆性技術(shù),解決一些原來想都不敢想的問題,推動產(chǎn)生更多‘從0到1’的成果?!表n藍(lán)青表示。
創(chuàng)業(yè)路上,對韓藍(lán)青來說,“讓AI照進(jìn)生物產(chǎn)業(yè)”是他的新目標(biāo)。
標(biāo)簽:
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